黒住耐二は、伊礼原Ｅ遺跡の5区について、内湾が多く占め、非食用の小形種が多いことから、「自然貝層」と判断している。また、別のところでは、貝塚時代前2期後葉と位置づけている（『平安山原B・C遺跡』）。
しかし上位の貝を見れば、これは「自然貝層」ではなく、島人の選択が働いている。苧麻トーテム段階の貝たちだ。
5・6区、3区については、前3・4期と判断されている（『平安山原B・C遺跡』）。両区は、浜辺と干瀬の表現が高い。上位の貝は、ビッグネームたちだ。サンゴ礁トーテム段階の貝たちだと言える（土器では前5期）。